柴胡加工随收获随加工，不要堆积时间过长，以防霉烂。把采挖的根用水冲洗干净进行晒干即可。当晒到7-8成干时，把须根去净，根条顺直，捆成小把再继续晒干为止，将晒好的柴胡按收购要求装箱出售。
柴胡炮制工艺：
柴胡：除去杂质和残茎，洗净，润透，切厚片，干燥。
醋柴胡：取柴胡，加醋拌匀，闷透（约4-6小时），置锅内，用文火炒干，取出，放凉。每100kg柴胡，用醋20kg。
柴胡储藏养护：
柴胡一般为压缩打包，每件50公斤。贮存于通风干燥仓库内，温度30℃以下，相对湿度65-75%。商品安全水分9-12%。
本品易虫蛀，受潮生霉，有螨虫寄居。受潮品软润，有的表面现霉斑。为害的仓虫有锯谷盗、小蕈甲、黑皮蠹、大竹蠹、烟草甲等，蛀蚀品表面现蛀粉，敲打时有活虫落下。高温高湿季节，可见螨虫活动。
储藏期间，应保持环境整洁、干燥，并定期消毒。发现吸潮及轻度霉变、虫蛀，及时晾晒；严重时，用磷化铝或溴甲烷熏杀。有条件的地方可进行密封抽氧充氮养护。
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